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李春燕

发布时间:2019-09-25 16:35   点击次数:


李春燕 北京航空航天大学

大数据精准医疗高精尖创新中心

特聘副研究员、医工百人、博导

Email:lichunyan@buaa.edu.cn

 

教育经历:                                                                                                

09/2003—07/2009  中国科学院遗传与发育生物学研究所 博士 发育生物学  

09/1999—07/2003 山东师范大学 生命科学学院 学士 生物科学  

 

工作经历:    

06/2019今  北京航空航天大学 特聘副研究员  

06/2016—12/2017 美国德州大学MD安德森癌症中心 生物信息和计算生物学系 访问助理教授  

07/2009—06/2019 中国科学院北京基因组研究所 助理研究员、副研究员  

 

研究领域:  

利用多维基因组学数据的整合分析,研究人类重大疾病(肿瘤、老年疾病和遗传疾病等)的个体化诊疗策略,并进一步利用细胞系和模式生物解析增强子等调控元件的作用机制。

1. 从进化生物学的角度研究肿瘤内的异质性和肿瘤细胞的进化过程,探索新的癌症治疗模式。

2. 利用泛基因组数据,通过多维基因组学数据整合分析,在全基因组水平筛选与癌症发生发展紧密相关的增强子。以此为基础,结合CRISPRi-cas9技术,在多种癌细胞系中筛选与某种表型(增殖、迁移和抗药性等)紧密相关的增强子,进一步解析这些增强子的调控机制。以此为基础,探索新的癌症诊断和治疗策略。

3. 在全基因组水平筛选和挖掘参与成骨细胞分化的增强子和转录调控因子;结合GWAS、Hi-C和ChIP-Seq等多维基因组学数据,解析“增强子-转录因子-靶基因”调控路径;在细胞和小鼠模型中,利用CRISPR-cas9技术,解析候选增强子对成骨细胞分化调控的分子机制,并探索通过促进成骨细胞分化治疗骨质疏松的策略。

4. 利用家族谱系的外显子组(和全基因组)测序数据,解析罕见遗传疾病的新的致病基因,探索个体化诊疗模式。

 

发表文章:  

1. F. Ma*, G. Lu*, Q. Chen, Y. Ruan, X. Li, X. Lu#, C. Li#, Dynamic global analysis of transcription reveals the role of miRNAs in synergistic stabilization of gene expression, Science Bulletin, 65, 2130-2140 (2020).

2. 刘倩, 李春燕, 增强子的鉴定及其在肿瘤研究中的应用, 遗传 (Hereditas), 42, 817-831 (2020)

3. T. Li*, J. Liu*, J. Feng*, Z. Liu, S. Liu, M. Zhang, Y. Zhang, Y. Hou, D. Wu, C. Li, Y. Chen, H. Chen, X. Lu#, Variation in the life history strategy underlies functional diversity of tumors, National Science Review, Online in advance (2020)

4. S. Liu*, Z. Yang*, G. Li*, C. Li, Y. Luo, Q. Gong, X. Wu, T. Li, Z. Zhang, B. Xing, X. Xu#, X. Lu#, Multi-omics analysis of primary cell culture models reveals genetic and epigenetic basis of intratumoral phenotypic diversity, Genomics Proteomics Bioinformatics 17, 576-589 (2019)

5. X. Bai*, Z. Liu*, X. Shao, D. Wang, E. Dong, Y. Wang, C. Wu, Y. Yuan, X. Lu#, C. Li#, The heterogeneity of plasma miRNA profiles in hepatocellular carcinoma patients and the exploration of diagnostic circulating miRNAs for hepatocellular carcinoma, PLoS ONE 14, e0211581 (2019).

6. H. Chen*, C. Li*, X. Peng, Z. Zhou, The Cancer Genome Atlas Research Network, J. N. Weinstein, H. Liang, A Pan-Cancer Analysis of Enhancer Expression in Nearly 9000 Patient Samples. Cell 173, 386-399 (2018).

7. H. Chen*, C. Li*, Z. Zhou, H. Liang, Fast-evolving human-specific neural enhancers are associated with aging-related diseases. Cell Systems 6, 604-611 (2018).

8. C. Li*, Y. Hou*, J. Xu*, A. Zhang, Z. Liu, F. Qi, Z. Yang, K. Chen, S. Liu, H. Huang, Q. Wang, J. Dong, C. Wu, X. Lu, A direct test of selection in cell populations using the diversity in gene expression within tumors. Molecular Biology and Evolution 34, 1730-1742 (2017).

9. C. Li*, Z. Liu*, F. Yang*, W. Liu, D. Wang, E. Dong, Y. Wang, C. Wu, X. Lu, siRNAs with decreased off-target effect facilitate the identification of essential genes in cancer cells. Oncotarget 6, 21603-21613 (2015).

10. Y. Tao*, Z. Hu*, S. Ling*, S. Yeh, W. Zhai, K. Chen, C. Li, Y. Wang, K. Wang, H. Wang, E. A. Hungate, K. Onel, J. Liu, C. Zeng, R. R. Hudson, P. Chen, X Lu#, C. Wu#, Further genetic diversification in multiple tumors and an evolutionary perspective on therapeutics, bioRxiv 2015:025429

11. Z. Chong*, W. Zhai*, C. Li, M. Gao, Q. Gong, J. Ruan, J. Li, L. Jiang, X. Lv, E. Hungate, and C. I. Wu, The evolution of small insertions and deletions in the coding genes of Drosophila melanogaster. Molecular Biology and Evolution 30, 2699-2708 (2013).

12. J. Ruan*, L. Jiang*, Z. Chong*, Q. Gong*, H. Li, C. Li, Y. Tao, C. Zheng, W. Zhai, D. Turissini, C. H. Cannon, X. Lu#, C. I. Wu#, Pseudo-Sanger sequencing: massively parallel production of long and near error-free reads using NGS technology. BMC Genomics 14, 711 (2013).

13. Y. Tao*, J. Ruan*, S. H. Yeh*, X. Lu*, Y. Wang*, W. Zhai*, J. Cai*, S. Ling, Q. Gong, Z. Chong, Z. Qu, Q. Li, J. Liu, J. Yang, C. Zheng, C. Zeng, H. Y. Wang, J. Zhang, S. H. Wang, L. Hao, L. Dong, W. Li, M. Sun, W. Zou, C. Yu, C. Li, G. Liu, L. Jiang, J. Xu, H. Huang, C. Li, S. Mi, B. Zhang, B. Chen, W. Zhao, S. Hu, S. M. Zhuang, Y. Shen, S. Shi, C. Brown, K. P. White, D. S. Chen#, P. J. Chen, C. I. Wu#, Rapid growth of a hepatocellular carcinoma and the driving mutations revealed by cell-population genetic analysis of whole-genome data. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 108, 12042-12047 (2011).

14. X. Lu*, J. A. Shapiro*, C. T. Ting, Y. Li, C. Li, J. Xu, H. Huang, Y. J. Cheng, A. J. Greenberg, S. H. Li, M. L. Wu, Y. Shen, C. I. Wu, Genome-wide misexpression of X-linked versus autosomal genes associated with hybrid male sterility. Genome Research 20, 1097-1102 (2010).

15. C. Li, Z. Guo, Z. Wang, TGFß receptor saxophone non-autonomously regulates germline proliferation in a Smox/dSmad2-dependent manner in Drosophila testis. Developmental Biology 309, 70-77 (2007).

* These authors contribute equally

# corresponding authors

 

 

承担科研项目:

1. 国家自然科学基金-面上项目,促进成骨细胞分化的增强子对抗骨质疏松症的效应和机制研究,2021/01 – 2024/12,在研,主持

2. 国家自然科学基金-青年科学基金项目,利用CRISPR-cas9系统筛选和解析与癌症发生发展相关的增强子 2019/01 – 2021/12,在研,主持

3. 科技部国家重大科学研究计划项目,肿瘤异质性的分子网络研究和新治疗策略,2014/01 – 2018/08,结项,课题骨干

4. 科技部863计划项目,肿瘤的个体化RNA干扰治疗,2012/11 – 2015/12,结项,课题骨干

 

利:

1. 李春燕、刘倩、张永彪、刘超,一种可用于抑制肿瘤增殖的非编码基因及其应用,202010361001.4(实质审查阶段)。

2. 李春燕、董恩成、刘珍珍、吕雪梅、吴仲义筛选肿瘤早期诊断靶标的Small RNA-Seq库的构建方法ZL201210041472.2

3. 李春燕、杨芳、刘稳升、王瑜、吕雪梅、吴仲义用于恶性肿瘤治疗的组合物及其应用ZL201210046682.0


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