叶盛 特聘研究员、博士生导师、医工百人
医工交叉创新研究院 大数据精准医疗高精尖创新中心
北航教师个人主页:http://shi.buaa.edu.cn/yesheng/
电子邮箱:yesheng@buaa.edu.cn
【研究领域】
[1] 癌症等重大疾病的分子病理机制及相应的早期药物研发,尤其关注癌症转移的分子机制。
[2] 病毒入侵宿主细胞的分子机制研究及相应的早期药物研发,尤其关注艾滋病毒、冠状病毒等具备融合核心的病毒。
[3] 从头开始的蛋白质设计及人工蛋白质库的构建,尤其关注能够替代抗体药物的小型螺旋束类蛋白。
[4] 人工智能在生物大分子结构研究与蛋白质设计中的应用,尤其关注螺旋结构预测与蛋白-蛋白相互作用预测。
【教育背景】
2000.9–2007.1 清华大学,生物系/基础医学院,生物学博士学位(导师:饶子和院士)
1996.9–2000.7 清华大学,自动化系,自动化学士学位
【工作经历】
2019.4至今 北京航空航天大学,医工交叉创新研究院,大数据精准医疗高精尖创新中心,特聘研究员
2010.3–2019.4 中国科学院生物物理研究所,生物大分子国家重点实验室,副研究员
2007.7–2010.3 美国霍华德·休斯医学研究所/哥伦比亚大学,生物化学与分子生物物理学系,Wayne Hendrickson院士研究组,博士后科学家
2007.1–2007.7 清华大学,基础医学院,饶子和院士研究组,研究助理及学术秘书
【社会任职】
中国生物物理学会分子生物物理分会理事
中国生物物理学会科普工作委员会秘书长
中国科普作家协会理事
中国科学技术协会“科普中国形象大使”
【代表性科研项目】
[1] 主持了中华人民共和国科学技术部国家重点基础研究发展计划“973”子课题,“UPS等修饰分子机制的结构研究”,2012–2016。
[2] 主持了国家自然科学基金面上项目,“重要癌症转移促进因子 Talin 蛋白的自抑制机制研究”,2013–2016。
[3] 主持了国家自然科学基金面上项目,“双功能连接酶Smurf1催化Neddylation的机制研究”,2015–2018。
[4] 主持有国家自然科学基金面上项目,“组蛋白生物素化修饰的调控机制研究”,2019–2022。
[5] 参加了国家自然科学基金国际合作项目,“FBLD技术平台在抗菌新药研究中的应用”,2016–2019。
[6] 主持有与中国化工集团先正达公司中国研发中心合作的研究项目,“关于杀虫毒素蛋白的作用机制研究”,2017–2021。
[7] 主持有与望石智慧公司合作的研究项目,“基于电子密度函数与人工智能的蛋白-蛋白相互作用界面预测算法研究”,2021–2023。
【代表性论著】
[1] Huang, Y.1, Lin, L.1, Liu, X.1, Ye, S.1, Yao, P. Y., Wang, W., Yang, F., Gao, X., Li, J., Zhang, Y., Zhang, J., Yang, Z., Liu, X., Yang,
Z., Zang, J., Teng, M., Wang, Z., Ruan, K., Ding, X., Li, L., Cleveland, D. W., Zhang, R.*, and Yao, X.* (2019) BubR1 phosphorylates CENP-E as a switch enabling the transition from lateral association to end-on capture of spindle microtubules. Cell Res. 29(7):562-78.
[2] Guo, N.1, Ye, S.1, Zhang, K.1, Yu, X.1, Cui, H., Yang, X., Lin, P., Lv, M., Miao, J., Zhang, Y., Han, Q., Zhang, R.*, Chen, Z.*,
and Zhu, P.* (2019) A critical epitope in CD147 facilitates memory CD4(+) T-cell hyper-activation in rheumatoid arthritis. Cell Mol Immunol. 16(6):568-79.
[3] Chen, B.1, Zhu, Y.1, Ye, S.*, and Zhang, R.* (2018) Structure of the DNA-binding domain of human myelin-gene regulatory factor reveals
its potential protein-DNA recognition mode. J Struct Biol. 203(2):170-8.
[4] Yang, H.1, Zhu, Y.1, Chen, X., Li, X.*, Ye, S.*, and Zhang, R.* (2018) Structure of a prokaryotic SEFIR domain reveals two novel SEFIR-SEFIR interaction modes. J Struct Biol. 203(2):81-9.
[5] Yang, Z.1, Han, S.1, Keller, M., Kaiser, A., Bender, B.J., Bosse, M., Burkert, K., Kogler, L.M., Wifling, D., Bernhardt, G., Plank, N.,
Littmann, T., Schmidt, P., Yi, C., Li, B., Ye, S., Zhang, R., Xu, B., Larhammar, D., Stevens, R.C., Huster, D., Meiler, J., Zhao, Q., Beck-Sickinger, A.G.*, Buschauer, A.*, and Wu, B.* (2018) Structural basis of ligand binding modes at the neuropeptide Y Y1 receptor.
Nature. 556(7702):520-4.
[6] Dai, S.1, Sun, C.1, Tan, K., Ye, S.*, and Zhang, R.* (2017) Structure of thrombospondin type 3 repeats in bacterial outer membrane
protein A reveals its intra-repeat disulfide bond-dependent calcium-binding capability. Cell Calcium. 66:78-89.
[7] Su, S.1, Zhu, Y.1, Ye, S.1, Qi, Q., Xia, S., Ma, Z., Yu, F., Wang, Q., Zhang, R.*, Jiang, S.*, and Lu, L.* (2017) Creating an Artificial
Tail Anchor as a Novel Strategy To Enhance the Potency of Peptide-Based HIV Fusion Inhibitors. J Virol. 91(1).
[8] Zhu, Y.1, Su, S.1, Qin, L.1, Wang, Q., Shi, L., Ma, Z., Tang, J., Jiang, S.*, Lu, L.*, Ye, S.*, and Zhang, R.* (2016) Rational improvement of
gp41-targeting HIV-1 fusion inhibitors: an innovatively designed Ile-Asp-Leu tail with alternative conformations. Sci Rep. 6:31983.
[9] Qin, L.1, Zhu, Y.1, Ding, Z., Zhang, X., Ye, S.*, and Zhang, R.* (2016) Structure of iridoid synthase in complex with NADP(+)/8-oxogeranial reveals the structural basis of its substrate specificity. J Struct Biol. 194(2):224-30.
[10] Wang, Z., Qiao, Z., Ye, S.*, and Zhang, R.* (2015) Structure of a double-domain phosphagen kinase reveals an asymmetric arrangement of the tandem domains. Acta Crystallogr D Biol Crystallogr. 71(Pt 4):779-89.
[11] Lu, L.1, Liu, Q.1, Zhu, Y.1, Chan, K.H., Qin, L., Li, Y., Wang, Q., Chan, J.F., Du, L., Yu, F., Ma, C., Ye, S., Yuen, K.Y.*, Zhang, R.*,
and Jiang, S.* (2014) Structure-based discovery of Middle East respiratory syndrome coronavirus fusion inhibitor. Nat Commun. 5:3067.
[12] Shi, D.J.1, Ye, S.1, Cao, X., Zhang, R.*, and Wang, K.* (2013) Crystal structure of the N-terminal ankyrin repeat domain of TRPV3 reveals unique conformation of finger 3 loop critical for channel function. Protein Cell. 4(12):942-50.
[13] Liu, Y.1, Zhu, Y.1, Ye, S.*, and Zhang, R.* (2012) Crystal structure of kindlin-2 PH domain reveals a conformational transition for its membrane anchoring and regulation of integrin activation. Protein Cell. 3(6):434-40.
[14] Wu, X.1, Ye, S.1, Guo, S., Yan, W., Bartlam, M., and Rao, Z.* (2010) Structural basis for a reciprocating mechanism of negative cooperativity
in dimeric phosphagen kinase activity. FASEB J. 24(1):242-52.
[15] Guo, S.1, Ye, S.1, Liu, Y., Wei, L., Xue, J., Wu, H., Song, F., Zhang, J., Wu, X., Huang, D.*, and Rao, Z.* (2009) Crystal structure of Bacillus
thuringiensis Cry8Ea1: An insecticidal toxin toxic to underground pests, the larvae of Holotrichia parallela. J Struct Biol. 168(2):259-66.
[16] Ye, S., Wu, X., Wei, L., Tang, D., Sun, P., Bartlam, M., and Rao, Z.* (2007) An insight into the mechanism of human cysteine dioxygenase.
Key roles of the thioether-bonded tyrosine-cysteine cofactor. J Biol Chem. 282(5):3391-3402.
【招生】
本研究组欢迎具备生物学、基础医学、人工智能等相关领域背景,并对疾病病理机制和药物研究感兴趣的同学加入,同时欢迎本科生来组开展实习。